近日，中國水稻研究所超級稻育種課題組在《作物學(xué)報（The Crop Journal）》在線發(fā)表了題為“通過上調(diào)Ehd1促進(jìn)普通野生稻抽穗的QTL -qHD1b的精細(xì)定位和候選基因分析（Fine mapping and candidate gene analysis of qHD1b， a QTL that promotes flowering in common wild rice （Oryza rufipogon） by up-regulating Ehd1）”的研究論文，報道了一個源自普通野生稻的早抽穗QTL-qHD1b的精細(xì)定位和候選基因分析。
抽穗期是決定水稻品種地區(qū)和季節(jié)適應(yīng)性的重要農(nóng)藝性狀，隨著耕地面積的不斷減少，培育早熟高產(chǎn)的水稻品種意義重大。目前，水稻中已克隆了15個抽穗期QTL，均克隆自栽培稻，鮮有報道克隆自野生稻。在栽培稻的馴化過程中，約有30-40%的遺傳變異丟失。因此，源自野生稻的自然變異，對于挖掘和克隆新的水稻抽穗期QTL提供了重要的遺傳資源。
研究者利用以中恢8015（ZH8015）為背景，將攜帶普通野生稻片段并表現(xiàn)為早抽穗的滲入系IL7391與ZH8015雜交，產(chǎn)生BC5F2：3家系進(jìn)行QTL分析。從中鑒定出兩個抽穗期 QTL，qHD1b和qHD7，并選擇前一個進(jìn)行進(jìn)一步研究。利用BC5F4：5和BC5F6群體進(jìn)行高分辨率連鎖分析，將qHD1b定位于第1染色體短臂上112.7-kb的區(qū)間內(nèi)，包含17個預(yù)測基因，其中5個在啟動子或編碼區(qū)含有多態(tài)的基因被認(rèn)為是候選基因。表達(dá)分析顯示LOC_Os01g11940的表達(dá)與早抽穗呈正相關(guān)，該位點(diǎn)被注釋為OsFTL1，編碼擬南芥FT的同源基因，是qHD1b最可能的候選基因。抽穗期相關(guān)基因表達(dá)分析發(fā)現(xiàn)，在短日照和長日照條件下，qHD1b作為開花激活因子，通過上調(diào)Ehd1、Hd3a、RFT1、OsMADS14和OsMADS15促進(jìn)抽穗。田間試驗表明，qHD1b對千粒重和粒長等產(chǎn)量相關(guān)農(nóng)藝性狀均有影響。qHD1b可用于進(jìn)行早熟品種的分子標(biāo)記輔助選擇育種。
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