基因組測(cè)序服務(wù)
一、文庫(kù)構(gòu)建
【服務(wù)介紹】
用限制性內(nèi)切酶切割細(xì)胞的整個(gè)基因組DNA,可以得到大量的基因組DNA片段,然后將這些DNA片段與載體連接,再轉(zhuǎn)化到細(xì)菌中去,讓宿主菌長(zhǎng)成克隆。這樣,一個(gè)克隆內(nèi)的每個(gè)細(xì)胞的載體上都包含有特定的基因組DNA片段,整個(gè)克隆群體就包含基因組的全部基因片段總和稱為基因組文庫(kù)?;蛭膸?kù)=基因組文庫(kù)+cDNA文庫(kù) 。
在基因組測(cè)序中,建庫(kù)測(cè)序是對(duì)提供的合格樣品進(jìn)行建庫(kù)并運(yùn)用illumina測(cè)序平臺(tái)測(cè)序,產(chǎn)生高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù),從而為客戶進(jìn)行生物信息學(xué)分析提供原始數(shù)據(jù)依據(jù)。
【服務(wù)流程】
【服務(wù)優(yōu)勢(shì)】
專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)
服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂
硬件保障:醫(yī)思倍實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及相關(guān)設(shè)備對(duì)所有客戶開放,歡迎隨時(shí)參觀
結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性
優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助
保密制度:嚴(yán)格執(zhí)行保密規(guī)程,充分保護(hù)客戶隱私信息,誠(chéng)信簽訂保密協(xié)議
正規(guī)發(fā)票:提供支付寶、微信、銀聯(lián)等多種便捷支付方式,可出具正規(guī)增值稅發(fā)票
【服務(wù)內(nèi)容】
序列 |
服務(wù)內(nèi)容 |
1 |
構(gòu)建基因組測(cè)序所需要的基因組文庫(kù) |
【樣本要求】
1、細(xì)胞、新鮮組織或總RNA/DNA樣品
2、細(xì)胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)直接液氮凍存后,-80℃保存
3、樣品運(yùn)輸:細(xì)胞或者組織樣品;或者總RNA樣本/DNA樣本置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運(yùn)輸
備注:不同測(cè)序方法,對(duì)樣本的要求不相同,請(qǐng)根據(jù)測(cè)序手段來確定送樣要求
【服務(wù)周期】:14天
【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)
【服務(wù)介紹】
全基因組DNA甲基化測(cè)序簡(jiǎn)稱WGBS(Whole-genome bisulfite sequencing),是將重亞硫酸鹽處理方法和Illumina HiSeq高通量測(cè)序平臺(tái)相結(jié)合,進(jìn)行全基因組范圍內(nèi)的精確甲基化研究。WGBS可以達(dá)到但堿基分辨率,精確分析每一個(gè)胞嘧啶的甲基化狀態(tài),從而構(gòu)建精細(xì)的全基因組DNA甲基化圖譜。
【服務(wù)流程】
|
專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)
服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂
硬件保障:醫(yī)思倍實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及相關(guān)設(shè)備對(duì)所有客戶開放,歡迎隨時(shí)參觀
結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性
優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助
保密制度:嚴(yán)格執(zhí)行保密規(guī)程,充分保護(hù)客戶隱私信息,誠(chéng)信簽訂保密協(xié)議
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【服務(wù)內(nèi)容】
序列 |
服務(wù)內(nèi)容 |
1 |
測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估 |
2 |
與參考基因組比對(duì) |
3 |
甲基化位點(diǎn)calling |
4 |
甲基化分布 |
5 |
差異甲基化分析 |
6 |
相關(guān)基因分析 |
7 |
多樣本分析 |
【樣本要求】
1、細(xì)胞,組織,總DNA等
2、建議起始量(單次):DNA>10ug,樣品濃度>50ng/ul, OD260/OD280在1.8到2.0之間
【服務(wù)周期】:45天
【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)
【服務(wù)介紹】
ChIP-seq:是結(jié)合位點(diǎn)分析法,將ChIP與第二代測(cè)序技術(shù)相結(jié)合的ChIP-Seq技術(shù),能夠高效地在全基因組范圍內(nèi)檢測(cè)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA區(qū)段。ChIP(Chromatin Immunoprecipitation)指染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù),是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用的有力工具,通常用于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)或組蛋白特異性修飾位點(diǎn)的研究。ChIP-Seq的原理是:首先通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(ChIP)特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA片段,并對(duì)其進(jìn)行純化與文庫(kù)構(gòu)建;然后對(duì)富集得到的DNA片段進(jìn)行高通量測(cè)序。通過將獲得的數(shù)百萬條序列標(biāo)簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA區(qū)段信息。
【服務(wù)流程】
【服務(wù)優(yōu)勢(shì)】
專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)
服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂
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結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性
優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助
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【服務(wù)內(nèi)容】
序列 |
服務(wù)內(nèi)容 |
1 |
測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估 |
2 |
與參考基因組比對(duì) |
3 |
peak峰calling |
4 |
motif分析 |
5 |
peak峰相關(guān)基因注釋 |
6 |
差異peak分析 |
7 |
相關(guān)基因功能分析 |
【樣本要求】
1、細(xì)胞≥2×107個(gè);動(dòng)物組織量≥200mg;植物組織量:葉片≥1.5g,莖≥2 g。
2、IP產(chǎn)物及input:濃度>0.1ng/uL,體積≥15uL,片段長(zhǎng)度200-500bp;通常input濃度≥50ng/uL,體積≥15uL(其它情況請(qǐng)聯(lián)系我們技術(shù)支持溝通)。
3、ChIP文庫(kù)濃度≥10nM,體積≥20μL,片段長(zhǎng)度200-500bp。
【服務(wù)周期】:45天
【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)
【服務(wù)介紹】
lncRNA測(cè)序(long noncoding RNA)是一類長(zhǎng)度超過200nt的長(zhǎng)鏈非編碼RNA,通過與DNA、RNA或蛋白結(jié)合,在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后等水平調(diào)控基因表達(dá)。lncRNA測(cè)序目前是研究已有參考基因組物種的特定組織或細(xì)胞在某個(gè)特定時(shí)期轉(zhuǎn)錄出的所有l(wèi)ncRNA和mRNA。
【服務(wù)流程】
【服務(wù)優(yōu)勢(shì)】
專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)
服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂
硬件保障:醫(yī)思倍實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及相關(guān)設(shè)備對(duì)所有客戶開放,歡迎隨時(shí)參觀
結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性
優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助
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【服務(wù)內(nèi)容】
序列
服務(wù)內(nèi)容
lncRNA分析
mRNA分析
1
lncRNA拼接組裝
反義轉(zhuǎn)錄本鑒定
2
lncRNA位點(diǎn)篩選
可變剪切分析
3
lncRNA編碼潛能分析
差異基因富集分析
4
lncRNA描述性統(tǒng)計(jì)
TSS和TTS位點(diǎn)統(tǒng)計(jì)
5
lncRNA靶基因預(yù)測(cè)
SNP/InDel分析
6
lncRNA保守性分析
mRNA保守性分析
7
ORF長(zhǎng)度分析及exon個(gè)數(shù)分析
ORF長(zhǎng)度分析及exon個(gè)數(shù)分析
8
表達(dá)水平分析及差異表達(dá)分析
表達(dá)水平分析及差異表達(dá)分析
【樣本要求】
1、細(xì)胞,組織,全血,總RNA等
2、建議總RNA起始量:10ug,最低5ug,人/大鼠/小鼠樣品可低至1ug,
3、濃度≥200 ng/uL(人/大鼠/小鼠樣品可低至≥50ng/ul)
【服務(wù)周期】:45天
【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)
【服務(wù)介紹】
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的研究對(duì)象為特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和,主要包括mRNA和非編碼RNA。轉(zhuǎn)錄組研究是基因功能及結(jié)構(gòu)研究的基礎(chǔ)和出發(fā)點(diǎn),通過新一代高通量測(cè)序,能夠全面快速地獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本序列信息,已廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、臨床診斷和藥物研發(fā)等領(lǐng)域。
【服務(wù)流程】
【服務(wù)優(yōu)勢(shì)】
專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)
服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂
硬件保障:醫(yī)思倍實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及相關(guān)設(shè)備對(duì)所有客戶開放,歡迎隨時(shí)參觀
結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性
優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助
保密制度:嚴(yán)格執(zhí)行保密規(guī)程,充分保護(hù)客戶隱私信息,誠(chéng)信簽訂保密協(xié)議
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【服務(wù)內(nèi)容】
序列 |
服務(wù)內(nèi)容 |
1 |
基因結(jié)構(gòu)水平分析 |
2 |
與參考基因組比對(duì) |
3 |
新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè) |
4 |
可變剪切分析 |
5 |
SNP分析 |
6 |
InDel分析 |
【樣本要求】
1、細(xì)胞,組織,全血,血清,血漿,總RNA等
2、建議總RNA起始量:2ug,最低1ug,濃度≥50ng /uL
【服務(wù)周期】:40天
【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)
【服務(wù)介紹】
環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)是最近發(fā)現(xiàn)的一類特殊的非編碼RNA,它大量存在于真核細(xì)胞胞質(zhì)內(nèi),主要由pre-mRNA通過可變剪切加工產(chǎn)生的,與傳統(tǒng)的線性RNA(linear RNA,含5’和3’末端)不同,circRNA分子呈封閉環(huán)狀結(jié)構(gòu),不受RNA外切酶影響,表達(dá)更穩(wěn)定,不易降解。在功能上,近年的研究表明,circRNA分子富含microRNA(miRNA)結(jié)合位點(diǎn),在細(xì)胞中起到miRNA海綿(miRNA sponge)的作用,進(jìn)而解除miRNA對(duì)其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表達(dá)水平;這一作用機(jī)制被稱為競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA(ceRNA)機(jī)制。通過與疾病關(guān)聯(lián)的miRNA相互作用,circRNA在疾病中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。
【服務(wù)流程】
【服務(wù)優(yōu)勢(shì)】
專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)
服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂
硬件保障:醫(yī)思倍實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及相關(guān)設(shè)備對(duì)所有客戶開放,歡迎隨時(shí)參觀
結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性
優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助
保密制度:嚴(yán)格執(zhí)行保密規(guī)程,充分保護(hù)客戶隱私信息,誠(chéng)信簽訂保密協(xié)議
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【服務(wù)內(nèi)容】
序列 |
服務(wù)內(nèi)容 |
1 |
參考序列比對(duì) |
2 |
circRNA鑒定 |
3 |
circRNA來源基因分析 |
4 |
circRNA表達(dá)水平定量 |
5 |
差異表達(dá)分析 |
6 |
GO、KEGG富集分析 |
7 |
miRNA結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè) |
【樣本要求】
1、細(xì)胞,組織,全血,總RNA等
2、建議總RNA起始量:10 ug,最低5ug,濃度≥200 ng/uL
【服務(wù)周期】:70天
【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)
【服務(wù)介紹】
擴(kuò)增子測(cè)序是對(duì)特定長(zhǎng)度的PCR產(chǎn)物或者捕獲片段進(jìn)行測(cè)序,對(duì)環(huán)境樣本進(jìn)行16s、ITS、18s高變區(qū)擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序,通過檢測(cè)目的區(qū)域的序列變異和豐度,可研究環(huán)境中微生物的多樣性及群落組成差異。
16S/18S rDNA為編碼原/真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列。ITS分為兩個(gè)區(qū)域:ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之間,ITS2位于5.8S和28S之間。
【服務(wù)流程】
【服務(wù)優(yōu)勢(shì)】
專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)
服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂
硬件保障:醫(yī)思倍實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及相關(guān)設(shè)備對(duì)所有客戶開放,歡迎隨時(shí)參觀
結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性
優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助
保密制度:嚴(yán)格執(zhí)行保密規(guī)程,充分保護(hù)客戶隱私信息,誠(chéng)信簽訂保密協(xié)議
正規(guī)發(fā)票:提供支付寶、微信、銀聯(lián)等多種便捷支付方式,可出具正規(guī)增值稅發(fā)票
【服務(wù)內(nèi)容】
序列 |
服務(wù)內(nèi)容 |
1 |
物種注釋 |
2 |
α-多樣性分析 |
3 |
β-多樣性分析 |
4 |
多元統(tǒng)計(jì)分析 |
5 |
CCA分析 |
6 |
環(huán)境因子關(guān)聯(lián)分析 |
7 |
VPA分析 |
8 |
功能預(yù)測(cè) |
9 |
腸型分析 |
10 |
貝葉斯網(wǎng)絡(luò)圖 |
11 |
Source Tracker |
【樣本要求】
1、菌體,DNA等
2、建議總DNA起始量:>20ng(較純DNA,無宿主及其他雜質(zhì)污染)
【服務(wù)周期】:10天
【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)
【服務(wù)介紹】
宏基因組學(xué)(Metagenomics)又叫微生物環(huán)境基因組學(xué)、元基因組學(xué)。它通過直接從環(huán)境樣品中提取全部微生物的DNA并測(cè)序,利用組學(xué)的研究策略研究環(huán)境樣品所包含的全部微生物的群落組成及其群落(基因)功能。
【服務(wù)流程】
【服務(wù)優(yōu)勢(shì)】
專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)
服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂
硬件保障:醫(yī)思倍實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及相關(guān)設(shè)備對(duì)所有客戶開放,歡迎隨時(shí)參觀
結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性
優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助
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【服務(wù)內(nèi)容】
序列 |
服務(wù)內(nèi)容 |
1 |
測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估 |
2 |
基因預(yù)測(cè) |
3 |
物種、功能注釋 |
4 |
CARD |
5 |
CAG/MLG分析 |
6 |
CNV(copy number variation) |
7 |
噬菌體 |
【樣本要求】
1、環(huán)境樣品,總DNA等
2、建議總DNA起始量:5 ug,最低0.5ug,濃度≥30 ng/uL(Qubit定量)
【服務(wù)周期】:26.5天
【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)