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解決方案

基因組測(cè)序服務(wù)

一、文庫(kù)構(gòu)建 


【服務(wù)介紹】

用限制性內(nèi)切酶切割細(xì)胞的整個(gè)基因組DNA,可以得到大量的基因組DNA片段,然后將這些DNA片段與載體連接,再轉(zhuǎn)化到細(xì)菌中去,讓宿主菌長(zhǎng)成克隆。這樣,一個(gè)克隆內(nèi)的每個(gè)細(xì)胞的載體上都包含有特定的基因組DNA片段,整個(gè)克隆群體就包含基因組的全部基因片段總和稱為基因組文庫(kù)?;蛭膸?kù)=基因組文庫(kù)+cDNA文庫(kù) 。

在基因組測(cè)序中,建庫(kù)測(cè)序是對(duì)提供的合格樣品進(jìn)行建庫(kù)并運(yùn)用illumina測(cè)序平臺(tái)測(cè)序,產(chǎn)生高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù),從而為客戶進(jìn)行生物信息學(xué)分析提供原始數(shù)據(jù)依據(jù)。


【服務(wù)流程】


【服務(wù)優(yōu)勢(shì)】

專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)

服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂

硬件保障:醫(yī)思倍實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及相關(guān)設(shè)備對(duì)所有客戶開放,歡迎隨時(shí)參觀

結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性

優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助

保密制度:嚴(yán)格執(zhí)行保密規(guī)程,充分保護(hù)客戶隱私信息,誠(chéng)信簽訂保密協(xié)議

正規(guī)發(fā)票:提供支付寶、微信、銀聯(lián)等多種便捷支付方式,可出具正規(guī)增值稅發(fā)票


【服務(wù)內(nèi)容】

序列
服務(wù)內(nèi)容
1
構(gòu)建基因組測(cè)序所需要的基因組文庫(kù)


【樣本要求】

1、細(xì)胞、新鮮組織或總RNA/DNA樣品

2、細(xì)胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)直接液氮凍存后,-80℃保存

3、樣品運(yùn)輸:細(xì)胞或者組織樣品;或者總RNA樣本/DNA樣本置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運(yùn)輸

備注:不同測(cè)序方法,對(duì)樣本的要求不相同,請(qǐng)根據(jù)測(cè)序手段來確定送樣要求


【服務(wù)周期】:14天


【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)



二 、全基因組DNA甲基化測(cè)序


【服務(wù)介紹】

全基因組DNA甲基化測(cè)序簡(jiǎn)稱WGBS(Whole-genome bisulfite sequencing),是將重亞硫酸鹽處理方法和Illumina HiSeq高通量測(cè)序平臺(tái)相結(jié)合,進(jìn)行全基因組范圍內(nèi)的精確甲基化研究。WGBS可以達(dá)到但堿基分辨率,精確分析每一個(gè)胞嘧啶的甲基化狀態(tài),從而構(gòu)建精細(xì)的全基因組DNA甲基化圖譜。


【服務(wù)流程】


【服務(wù)優(yōu)勢(shì)】

專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)

服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂

硬件保障:醫(yī)思倍實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及相關(guān)設(shè)備對(duì)所有客戶開放,歡迎隨時(shí)參觀

結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性

優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助

保密制度:嚴(yán)格執(zhí)行保密規(guī)程,充分保護(hù)客戶隱私信息,誠(chéng)信簽訂保密協(xié)議

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【服務(wù)內(nèi)容】

序列

服務(wù)內(nèi)容

1

測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估

2

與參考基因組比對(duì)

3

甲基化位點(diǎn)calling

4

甲基化分布

5

差異甲基化分析

6

相關(guān)基因分析

7

多樣本分析

【樣本要求】

1、細(xì)胞,組織,總DNA等

2、建議起始量(單次):DNA>10ug,樣品濃度>50ng/ul, OD260/OD280在1.8到2.0之間


【服務(wù)周期】:45天


【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)



三、CHIP-seq


【服務(wù)介紹】

ChIP-seq:是結(jié)合位點(diǎn)分析法,將ChIP與第二代測(cè)序技術(shù)相結(jié)合的ChIP-Seq技術(shù),能夠高效地在全基因組范圍內(nèi)檢測(cè)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA區(qū)段。ChIP(Chromatin Immunoprecipitation)指染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù),是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用的有力工具,通常用于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)或組蛋白特異性修飾位點(diǎn)的研究。ChIP-Seq的原理是:首先通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(ChIP)特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA片段,并對(duì)其進(jìn)行純化與文庫(kù)構(gòu)建;然后對(duì)富集得到的DNA片段進(jìn)行高通量測(cè)序。通過將獲得的數(shù)百萬條序列標(biāo)簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA區(qū)段信息。


【服務(wù)流程】


【服務(wù)優(yōu)勢(shì)】

專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)

服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂

硬件保障:醫(yī)思倍實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及相關(guān)設(shè)備對(duì)所有客戶開放,歡迎隨時(shí)參觀

結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性

優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助

保密制度:嚴(yán)格執(zhí)行保密規(guī)程,充分保護(hù)客戶隱私信息,誠(chéng)信簽訂保密協(xié)議

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【服務(wù)內(nèi)容】

序列

服務(wù)內(nèi)容

1

測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估

2

與參考基因組比對(duì)

3

peak峰calling

4

motif分析

5

peak峰相關(guān)基因注釋

6

差異peak分析

7

相關(guān)基因功能分析


【樣本要求】

1、細(xì)胞≥2×107個(gè);動(dòng)物組織量≥200mg;植物組織量:葉片≥1.5g,莖≥2 g。

2、IP產(chǎn)物及input:濃度>0.1ng/uL,體積≥15uL,片段長(zhǎng)度200-500bp;通常input濃度≥50ng/uL,體積≥15uL(其它情況請(qǐng)聯(lián)系我們技術(shù)支持溝通)。

3、ChIP文庫(kù)濃度≥10nM,體積≥20μL,片段長(zhǎng)度200-500bp。


【服務(wù)周期】:45天


【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)



四、lncRNA測(cè)序


【服務(wù)介紹】

lncRNA測(cè)序(long noncoding RNA)是一類長(zhǎng)度超過200nt的長(zhǎng)鏈非編碼RNA,通過與DNA、RNA或蛋白結(jié)合,在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后等水平調(diào)控基因表達(dá)。lncRNA測(cè)序目前是研究已有參考基因組物種的特定組織或細(xì)胞在某個(gè)特定時(shí)期轉(zhuǎn)錄出的所有l(wèi)ncRNA和mRNA。


【服務(wù)流程】


【服務(wù)優(yōu)勢(shì)】

專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)

服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂

硬件保障:醫(yī)思倍實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及相關(guān)設(shè)備對(duì)所有客戶開放,歡迎隨時(shí)參觀

結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性

優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助

保密制度:嚴(yán)格執(zhí)行保密規(guī)程,充分保護(hù)客戶隱私信息,誠(chéng)信簽訂保密協(xié)議

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【服務(wù)內(nèi)容】


序列
服務(wù)內(nèi)容

lncRNA分析
mRNA分析
1 lncRNA拼接組裝
反義轉(zhuǎn)錄本鑒定
2 lncRNA位點(diǎn)篩選
可變剪切分析
3 lncRNA編碼潛能分析
差異基因富集分析
4 lncRNA描述性統(tǒng)計(jì)
TSS和TTS位點(diǎn)統(tǒng)計(jì)
5 lncRNA靶基因預(yù)測(cè)
SNP/InDel分析
6 lncRNA保守性分析
mRNA保守性分析
7 ORF長(zhǎng)度分析及exon個(gè)數(shù)分析
ORF長(zhǎng)度分析及exon個(gè)數(shù)分析
8 表達(dá)水平分析及差異表達(dá)分析
表達(dá)水平分析及差異表達(dá)分析


【樣本要求】

1、細(xì)胞,組織,全血,總RNA等

2、建議總RNA起始量:10ug,最低5ug,人/大鼠/小鼠樣品可低至1ug,

3、濃度≥200 ng/uL(人/大鼠/小鼠樣品可低至≥50ng/ul)


【服務(wù)周期】:45天


【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)



五、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序


【服務(wù)介紹】

轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的研究對(duì)象為特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和,主要包括mRNA和非編碼RNA。轉(zhuǎn)錄組研究是基因功能及結(jié)構(gòu)研究的基礎(chǔ)和出發(fā)點(diǎn),通過新一代高通量測(cè)序,能夠全面快速地獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本序列信息,已廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、臨床診斷和藥物研發(fā)等領(lǐng)域。


【服務(wù)流程】


【服務(wù)優(yōu)勢(shì)】

專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)

服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂

硬件保障:醫(yī)思倍實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及相關(guān)設(shè)備對(duì)所有客戶開放,歡迎隨時(shí)參觀

結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性

優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助

保密制度:嚴(yán)格執(zhí)行保密規(guī)程,充分保護(hù)客戶隱私信息,誠(chéng)信簽訂保密協(xié)議

正規(guī)發(fā)票:提供支付寶、微信、銀聯(lián)等多種便捷支付方式,可出具正規(guī)增值稅發(fā)票


【服務(wù)內(nèi)容】

序列

服務(wù)內(nèi)容

1

基因結(jié)構(gòu)水平分析

2

與參考基因組比對(duì)

3

新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè)

4

可變剪切分析

5

SNP分析

6

InDel分析


【樣本要求】

1、細(xì)胞,組織,全血,血清,血漿,總RNA等

2、建議總RNA起始量:2ug,最低1ug,濃度≥50ng /uL


【服務(wù)周期】:40天


【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)



六、circRNA測(cè)序


【服務(wù)介紹】

環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)是最近發(fā)現(xiàn)的一類特殊的非編碼RNA,它大量存在于真核細(xì)胞胞質(zhì)內(nèi),主要由pre-mRNA通過可變剪切加工產(chǎn)生的,與傳統(tǒng)的線性RNA(linear RNA,含5’和3’末端)不同,circRNA分子呈封閉環(huán)狀結(jié)構(gòu),不受RNA外切酶影響,表達(dá)更穩(wěn)定,不易降解。在功能上,近年的研究表明,circRNA分子富含microRNA(miRNA)結(jié)合位點(diǎn),在細(xì)胞中起到miRNA海綿(miRNA sponge)的作用,進(jìn)而解除miRNA對(duì)其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表達(dá)水平;這一作用機(jī)制被稱為競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA(ceRNA)機(jī)制。通過與疾病關(guān)聯(lián)的miRNA相互作用,circRNA在疾病中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。


【服務(wù)流程】


【服務(wù)優(yōu)勢(shì)】

專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)

服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂

硬件保障:醫(yī)思倍實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及相關(guān)設(shè)備對(duì)所有客戶開放,歡迎隨時(shí)參觀

結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性

優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助

保密制度:嚴(yán)格執(zhí)行保密規(guī)程,充分保護(hù)客戶隱私信息,誠(chéng)信簽訂保密協(xié)議

規(guī)發(fā)票:提供支付寶、微信、銀聯(lián)等多種便捷支付方式,可出具正規(guī)增值稅發(fā)票


【服務(wù)內(nèi)容】

序列

服務(wù)內(nèi)容

1

參考序列比對(duì)

2

circRNA鑒定

3

circRNA來源基因分析

4

circRNA表達(dá)水平定量

5

差異表達(dá)分析

6

GO、KEGG富集分析

7

miRNA結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè)


【樣本要求】

1、細(xì)胞,組織,全血,總RNA等

2、建議總RNA起始量:10 ug,最低5ug,濃度≥200 ng/uL


【服務(wù)周期】:70天


【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)


七、擴(kuò)增子16S/ITS測(cè)序


【服務(wù)介紹】

擴(kuò)增子測(cè)序是對(duì)特定長(zhǎng)度的PCR產(chǎn)物或者捕獲片段進(jìn)行測(cè)序,對(duì)環(huán)境樣本進(jìn)行16s、ITS、18s高變區(qū)擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序,通過檢測(cè)目的區(qū)域的序列變異和豐度,可研究環(huán)境中微生物的多樣性及群落組成差異。

16S/18S rDNA為編碼原/真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列。ITS分為兩個(gè)區(qū)域:ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之間,ITS2位于5.8S和28S之間。


【服務(wù)流程】


【服務(wù)優(yōu)勢(shì)】

專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)

服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂

硬件保障:醫(yī)思倍實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及相關(guān)設(shè)備對(duì)所有客戶開放,歡迎隨時(shí)參觀

結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性

優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助

保密制度:嚴(yán)格執(zhí)行保密規(guī)程,充分保護(hù)客戶隱私信息,誠(chéng)信簽訂保密協(xié)議

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【服務(wù)內(nèi)容】

序列

服務(wù)內(nèi)容

1

物種注釋

2

α-多樣性分析

3

β-多樣性分析

4

多元統(tǒng)計(jì)分析

5

CCA分析

6

環(huán)境因子關(guān)聯(lián)分析

7

VPA分析

8

功能預(yù)測(cè)

9

腸型分析

10

貝葉斯網(wǎng)絡(luò)圖

11

Source Tracker


【樣本要求】

1、菌體,DNA等

2、建議總DNA起始量:>20ng(較純DNA,無宿主及其他雜質(zhì)污染)


【服務(wù)周期】:10天


【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)



八、宏基因組測(cè)序


【服務(wù)介紹】

宏基因組學(xué)(Metagenomics)又叫微生物環(huán)境基因組學(xué)、元基因組學(xué)。它通過直接從環(huán)境樣品中提取全部微生物的DNA并測(cè)序,利用組學(xué)的研究策略研究環(huán)境樣品所包含的全部微生物的群落組成及其群落(基因)功能。


【服務(wù)流程】


【服務(wù)優(yōu)勢(shì)】

專業(yè)專注:10余年醫(yī)學(xué)科研行業(yè)經(jīng)驗(yàn),課題項(xiàng)目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負(fù)責(zé)

服務(wù)透明:項(xiàng)目反饋及時(shí),階段性說明實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目進(jìn)展情況,客戶無后顧之憂

硬件保障:醫(yī)思倍實(shí)驗(yàn)場(chǎng)地及相關(guān)設(shè)備對(duì)所有客戶開放,歡迎隨時(shí)參觀

結(jié)果保證:保證所有課題實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的真實(shí)性、客觀性

優(yōu)質(zhì)資源:學(xué)術(shù)資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學(xué)大多數(shù)專業(yè),根據(jù)不同需求,提供個(gè)性化輔導(dǎo)協(xié)助

保密制度:嚴(yán)格執(zhí)行保密規(guī)程,充分保護(hù)客戶隱私信息,誠(chéng)信簽訂保密協(xié)議

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【服務(wù)內(nèi)容】

序列

服務(wù)內(nèi)容

1

測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估

2

基因預(yù)測(cè)

3

物種、功能注釋

4

CARD

5

CAG/MLG分析

6

CNV(copy number variation)

7

噬菌體


【樣本要求】

1、環(huán)境樣品,總DNA等

2、建議總DNA起始量:5 ug,最低0.5ug,濃度≥30 ng/uL(Qubit定量)


【服務(wù)周期】:26.5天


【服務(wù)價(jià)格】:根據(jù)樣品類型和數(shù)量面議定價(jià)


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